С 01.01.2012 изменилась структура ТОГБУ «ГАСПИТО». Упразднены два структурных подразделения: отдел информационно-поисковых систем и автоматизированных архивных технологий (ИПС и ААТ) и лаборатория копирования, реставрации и переплета документов.

В настоящее время структура архива включает в себя администрацию и пять отделов:
- обеспечения сохранности и государственного учета документов;
- использования и публикации документов;
- комплектования, ведомственных архивов и делопроизводства, научно-технической обработки документов;
- использования и справочной работы;
- инженерно-технического обеспечения, эксплуатации и обслуживания зданий.

На 01.01.2012 штатная численность ТОГБУ «ГАСПИТО» - 56 человек.